Beni fue habitado por pobladores primitivos. Poco a poco se formó un mestizaje resultando en una serie de grupos étnicos, como los moxeños, itonamas, movimas, chapacuras, mocetones, tacanas, siriononos, chacobos, pausernas, chimanes y otros.

Cuando los españoles llegaron a este territorio, tuvieron que sortear muchas dificultades con los lugareños, de manera que en 1597 se encomendó a la Compañía de Jesús la fundación de misiones en el territorio que antiguamente era conocido como Tierra Nueva, Reino del Gran Paitití y Gran Moxos.

Creación1842

El departamento de Beni fue creado mediante Decreto Supremo del 18 de noviembre de 1842, promulgado durante el  gobierno del Gral. José Ballivián.

Fundación1687

El sacerdote Jesuita Cipriano Baraci y Manuel Castro Castillo y Padilla  fundaron Beni el 6 de junio de 1687 como “Ciudad de la Santísima Trinidad”.